Pemerintah Kabupaten Jayapura

Kabupaten Jayapura lahir berbarengan dengan pembentukan provinsi Irian Barat, lewat UU No 12 tahun 1969 tentang Pembentukan Provinsi Otonom Irian Barat dan Kabupaten-kabupaten Otonom di Provinsi Irian Barat. Yang ketika itu ditetapkan menjadi ibukotanya adalah Jayapura. Lewat UU No 6 tahun 1993, Kota Jayapura dimekarkan jadi daerah otonom. Maka, lewat PP No 15 tahun 2000, ibukota Kabupaten Jayapura pun akhirnya dipindahkan ke wilayah Sentani, yang berada di sebelah barat kota Jayapura.

Pasca kepindahan ibukota, lahan eks kantor bupati Jayapura di kota Jayapura dikaryakan dengan pola BOT dengan pihak swasta dan disulap menjadi Mal Jayapura, yang antara lain ditempati oleh Hypermart.